沈滞に陥り、破滅に向かう「金字塔都市(シティ・オブ・ザ・ピラミッズ)」。その定められた結末を超越えるには七騎のサーヴァントの助力が必要である。影の国の女王と出会った一介の魔術講師は、彼女と契約を交わし運命に挑む。物語の幕が上がり、聖杯を破壊するための異質な「聖杯戦争」が始まる。