とある地方都市、青海ヶ原。その地では今、肉体精神共に悪影響を及ぼす「瘴気」が各地で発生し、街の住人や自然界に隠れ住む妖怪たちに被害が及び始めていた。 流れの退魔師である占部雷は、人知れず退魔の巫女として活躍していた幼馴染、伊武凪風と共に、生まれ育った青海ヶ原を守護る為、瘴気の発生原因を調査し、その大元を絶つことに。 だが調査が進むうちに、この地における古代からの忌まわしき因縁が、その鎌首をもたげ始めるのだった…